Francesco Caputo del Empoli è sceso in campo nella maggior parte delle gare del club in Serie A nel 2023/2024, avendo collezionato 15 presenze, per un totale di 1106 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 14 presenze su 28 giornate ed è entrato 1 volta.
La sua ultima presenza in Serie A è stata il 7 gennaio, partita in cui ha giocato 74 minuti con la maglia del Empoli contro il Milan, nella sconfitta per 3-0. In totale l'attaccante ha segnato 3 reti nel 2023/2024 - secondo a pari merito tra i giocatori del suo club.
É stato contro il Sassuolo il 26 novembre che Caputo ha segnato il suo ultimo gol, nella sconfitta per 4-3. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro la Fiorentina il 23 ottobre, avendo realizzato una rete nella vittoria per 2-0.
La prossima gara per l'Empoli - che occupa il 16° posto con 25 punti - sarà una sfida casalinga contro il Bologna, il 15 marzo.
Nell'ultima stagione con l'Empoli in Serie A Caputo ha collezionato 21 presenze, gare in cui ha realizzato 5 gol e fornito 4 passaggi vincenti.
A gennaio 2023 Caputo, in quel periodo giocatore della Sampdoria, ha iniziato a giocare per l'Empoli in prestito. Ha collezionato 15 presenze in campionato in totale con la Sampdoria, realizzando uno gol. Il suo passaggio a giocatore del Empoli è stato definitivo a luglio 2023.
Il 3 ottobre 2010 Caputo ha fatto il suo esordio in Serie A con Bari, all'età di 23 anni e 58 giorni, contro il Genoa. Ha avuto un buon impatto al suo debutto in Serie A con il suo club attuale, l'Empoli, avendo segnato contro il Cagliari il 19 agosto 2018.
In totale, nella sua carriera in Serie A, conta 200 presenze con 69 gol e 24 assist per i compagni. Nonostante abbia giocato 200 partite in Serie A finora, Caputo non è ancora stato espulso nella competizione.